Sim, o chá de carqueja pode ter contra indicação para algumas pessoas, principalmente aquelas que possuem problemas digestivos, como úlceras estomacais ou intestinais, ou que possuem alergia a alguma substância presente na planta. Além disso, gestantes, lactantes e crianças com menos de 12 anos devem evitar o consumo de chá de carqueja sem orientação médica. Pessoas que fazem uso de medicamentos controlados também devem consultar um médico ou um naturopata antes de consumir o chá de carqueja, pois ele pode interagir com alguns medicamentos e causar efeitos colaterais.