Enquanto o chá de camomila é seguro para a maioria das pessoas, há algumas contra-indicações a serem consideradas:
Pessoas com alergia a plantas da família Asteraceae (como margaridas, girassóis e crisântemos) devem evitar camomila, pois podem ter uma reação alérgica.
Pessoas com diabetes devem ter cuidado ao consumir grandes quantidades de chá de camomila, pois pode aumentar os níveis de açúcar no sangue.
Pessoas com pressão arterial baixa devem evitar o chá de camomila, pois pode diminuir ainda mais a pressão arterial.
Mulheres grávidas e lactantes devem consultar um médico antes de consumir camomila, pois pode causar problemas em algumas situações.
Pessoas que estão tomando medicamentos sedativos ou que causam sonolência devem evitar o chá de camomila, pois pode aumentar os efeitos sedativos desses medicamentos.